基因芯片DNA芯片在法医学检测中已有成功应用，因而上海亲子鉴定DNA甲基化检测芯片同样具有一定的法医学应用前景。这包括用于整个基因组范围内扫描的差异甲基化杂交和用于检测已知特定CpG位点的甲基化特异性微阵列。最近美国丑lumina公司所开发的用于全基因组DNA甲基化扫描的光纤微珠芯片(Infinium⑧Huma嘻Methylation27)即属于后者。此芯片的上海亲子鉴定基本原理是通过重亚硫酸盐对模板DNA 进行转化后，通过单碱基延伸对特定CpG位点进行甲基化状态检测。该芯片可同时对人基因组DNA 14 495个基因上已知的27 578个CpG位点的甲基化状态进行扫描，并已应用于多项表观上海亲子鉴定遗传学研究，获得了可靠的研究成果(Irizarry et al. ， 2008）。

       另外，Illumina公司还可依据GoldenGate策略对多达1536 个CpG位点进行微珠芯片定制。通过此工具有望筛选出可用于法医学鉴定的DN NA 甲基化位点。除上述方法外，位点特异性的上海亲子鉴定DNA甲基化分析还有很多方法，如甲基化敏感性限制性内切核酸酶-PCR(metl-重亚硫酸盐联合限制性内切核酸酶分析(c(甲基化敏感性解链曲线分析（methyla 及甲基化敏感性单链构象分析方法在一些甲基化方法综述中已有较为详细的描述。但这些方法由于本身敏感性及自动化程度不高等原因，可能不适合在法医遗传学实验室常规开展。

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