与常染色体STR基因座比较，Y-STR分型的上海亲子鉴定法医学应用具有以下特点：①Y染色体为男性所特有，对单拷贝Y-STR基因座，每个男性个体仅有1个等位基因，因此Y-STR分析在法医物证鉴定中的特殊意义在于混合斑迹鉴定，例如性犯罪案件中男性罪犯的个体识别以及轮奸案或多个体男性混合斑迹中推断男性个体的最少人数；而多拷贝Y-STR基因座，每个男性可有一到多个等位基因，且分型结果中单峰和多峰间呈明显的剂量效应关系。②Y-STR呈父系遗传特征，只能由父亲传递给儿子，同一父系的所有男性个体均具有相同的Y-STR单倍型（除非发生突变），故在上海亲子鉴定父系亲缘关系鉴定中有一定实用价值。③在减数分裂过程中，Y-特异性区不发生重组，所有Y-STR基因座均连锁遗传，故不能采用乘法原则将各基因座等位基因频率相乘，而应将所有Y-STR基因座分型结果视为1个单倍型，再根据被测男性所在群体的单倍型频率分布评估证据价值。目前最大、使用最广泛的.