尽管与小卫星Amp-FLP相比，PCT-STR分型技术具有以下优势：①STR基因座的扩增片段较短，因而灵敏度更高，尤适用于亲子鉴定微量或降解生物检材的DNA分型；②等位基因片段长度范围较窄，不易发生因小等位基因的优势扩增而造成的等位基因丢失现象；③可对多个STR基因座进行复合扩增，从而节约检材、降低成本，提高单次检测的信息量。但面对极微量或严重降解生物检材，有时仍会出现分型失败或因优势扩增而致等位基因丢失的现象。为了解决上述问题，可通过亲子鉴定重新设计引物，使其结合在更靠近核心重复区的侧翼序列，从而降低扩增产物的大小，进一步提高灵敏度和分型成功率，这种技术称为短片段STR分型或“miniSTR"分型(图4-12)。