7VNTR库列长度多态性示意图
1.VNTR长度多态性特征 序列分析发现,小卫星VNTR基I鼠座具有某些共同的特征。
(1)亲子鉴定重复单位长度9~24bp,重复次数少则数次,多则数百次,基因长度范围0. 1~20. Okb。不同的小卫星在基因组中都有特定的染色体定位,就重复单位而言,重复序列是多拷贝的;而对于特定基因座的等位基因,则是单拷贝的。
(2)亲子鉴定小卫星重复单位的碱基构成分析发现,所有的重复单位几乎都有一共同的富含G/C或A/T碱基的核心序列。以下是几个常见小卫星的核心序列。
c【珠蛋白HVR GGGGCACAGGTTGT
胰岛素HVR GGGGACAGGGGTCT
z珠蛋白:基因HVR GGGGACAGTGAGGA
Ha-ras基冈-HVR CCTGGAGAGAAGGGGAGTGTGC(_CTCC
核心序列 GGAGGTGGGCAGGAXG
此,不同座位的小卫星VNTR序列间具有同源性,可发生相互杂交。
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