全序列上海亲子鉴定测序分析进入21世纪以后，随着测序成本的大大降低，许多研究小组相继发表了世界各地人群mtDNA全序列的研究报告。对全序列的分析不杠仅验证了通过RFLP 和HVS得到的结果，还为建立高解析度的世界人群mtDNA系统关系提供孑大量的信息。在东亚地区mtDNA研究领域，近几年来的一系列报道构建了更高分辨率的系统树，在主要的东亚谱系内部，确定了很多的细微分支。考察这些高分辨率谱系在东亚人群中的分布，可以为追溯东亚人群的母系遗传历史提供宝贵的素材。相对其他方法来说，全序列测序能提供精确的信息，但在实际操作中珑费较大。）其他分型技术除前面介绍的方法外，一些用于mtDNA多态性检测的新技术报道.

      应用上海亲子鉴定荧光定量PCR技术，建立了mtDNA 16 519位点的PCR分型方法。蒋琼橙等(2004)采用变性高效液相色谱技术检测了mtDNA编码区10 287~10 679及8507~8805位点的多态性。程祖建等(2009) 采用等位基因特异PCR结合熔解曲线快速分析检测了线粒体DNA 1555位点的突变。许传超等(2003)采用引物延伸飞行时间质谱法对mtDNA进行了快速测定。事实上，在前节中介绍的关于SNP分型的新技术同样适用于mtDNA的多态性检测，这里就不再重复。

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