插入缺失多态性遗传标记的应用前景STR基因座的高突变率这一缺陷促使上海亲子鉴定法医物证工作者致力于寻找更为稳定的遗传标记。InDel作为一种特殊的二态性遗传标记,与单核苷酸多态性<sin-gle nuc」eotide polymorphjsm, SNP) 具有相近的自然突变率,其突变率显著低于STR。同时,InDel的两个等位基因表现为片段长度多态性,这又与STR的等位基因的特征类似,使其可以采用目前法医DNA鉴定领域常用的复合荧光多重PCR联合毛细管电泳分型技术进行分型检测,因而成为法医DNA鉴定关注的热点。
在本节介绍的上海亲子鉴定法医物证InDel研究中,通过全基因组浏览器这一有效的人类基因扫描工具,筛选获得了30个散布于22条常染色t 体上、互不连锁的InDel位点,并以此为基础联合Amelogenin基因座上的性别鉴定位点,采用复合荧光多重PCR技术建立了包含30个InDel位点和1个性别位点的多重PCR体系——址Del_ typer30, 并建立了相应的GeneMapper v3. 2软件的分析方法,从而组合成了一套切实可行的法医DNA鉴定工具。实际应用表明,Inl)el_typer30系统的分型是准确的d在中国汉族、回族、维吾尔族、蒙古族、藏族5个民族中进行的遗传多态性的调查也表明,这30个InDel位点在上述5个民族中的平均期望杂合度分别达到了0.464、0.460、0.453、0.466、0.469,平均个体识别效能分别达到了0.595、0.585、0.586、0.589、0.595,而CDP值分别达到了0.999 999 999 998 41、 0.999 999 999 996 90、 0.999 999 999 997 09、0. 999 999 999 997 72、 0. 999 999 999 998 54。
这也表明InDel - typer30 系统对于中国这5个主要民族,无论是进行上海亲子鉴定法医物证亲权鉴定或是个体识别均是一个有效的工具。已有研究表明,在一个达到遗传平衡的理想群体中,对于二等位基因遗传标记,如SNP、InDel等,当其最低等位基因频率达到0.500时,其个体识别效能达到最高。3个这样的位点其CDP可达到0.947,这一CDP值相当于】个目前个体识别常用STR基因座的DP值。因此,可以推测InDel_typer30系统的CDP值近似于12个常用STR基因座的CDP。需要注意的是,在该系统中所有InDel位点的扩增子长度均小于260bp,这虽然成为限制这一系统所包含的InDe」位点数的因素之一,但同时也成为这一系统的一个优势,使其具备了应用于降触DNA检材的潜能。InDel_typer30系统的不足之处在于所包含的位点数仍不够多,而采用诸如InDel这样的二等位基因遗传标记进行法医学DNA鉴定所面临的共同难点之一是需要的位点数较多。如前所述,要达到与目前上海亲子鉴定法医物证法医DNA鉴定中常用的商业STR分型试剂盒(如Sinofiler系统)同等个体识别效能约需要60个这样的位点,这将显著增加相应多重PCR扩增体系构建的难度。但显然,InDel上typer30系统的出现已为InDel标记在中国人群中的应用奠定了一定的基础。
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