这就是为什么上海亲子鉴定STR基因座通常具有多态性的原因之一(伴随着假定的中性选择)。本质上，这是使得此类位点在法医学上成为含有丰富信息量的标记的一个属性。然而，大多数成像系统都不能检测到这类碱基替换的现象，因为这类碱基替换产生了与未发生突变的序列同样大小的等位基因产物。对任何公认的父系突变进行的观察将会大大降低父权指数的值。因此，避免使用具有上海亲子鉴定高突变率的位点似乎就是明智的。然而，一个有用的位点也应该是具有高度多态性的。突变率和多态性之间存在一个总的正相关性，这个正相关性使得我们选择用于调查父权关系的微卫星位点变得非常困难。STR基因座具有的相对较高的上海亲子鉴定突变率来源于STR基因座复制序列的串联排列。通过观察重复序列的一个或者多个单元出现增加或者损失的现象，我们可以以一种可预言的且特有的方式对STR基因座上发生的基因突变进行观察。为了对这种观察结果予以说明，至少有两种可能的解释已经被提了出来。