最近，线粒体上海亲子鉴定DNA，X染色体、Y染色体等非常染色体简单三联体家系图DNA开始在亲缘鉴定中发挥越来越重要的作用。Y染色体大部分上海亲子鉴定遗传过程中不重组且呈连锁遗传。Y-STR遗传标记构成“单倍型”，除非发生突变，否则这个单倍型在同一父系完全相同。这种遗传模式使得这类遗传标记可以在缺少亲属（又称为比对人员缺失）或隔代的亲缘鉴定案件中使用。X染色体在女性中可以重组但在男性中则不能，正如在第9章中所讨论的，某些法医学关注的基因座有可能发生连锁。X染色体的优势也体现在其在亲属缺失情况下进行亲缘鉴定，当无法从上海亲子鉴定可疑父亲得到生物样本时可以采集父系样本代替。同一父亲所生的女儿拥有共同的X染色体。750 线粒体DNA在第9章也进行了讨论，它在哺乳动物中呈非重组的母系遗传，作用与Y染色体在亲属缺失情况下进行亲缘鉴定的作用柏1以。