我们完全可以想象，这种折中对于不同的复合而言也是不同的，或者这种折中可能会随着上海亲子鉴定系统的演进而在未来发生变化。有一些上海亲子鉴定证据表明，通过使用巢式单基因座引物738，739我们可以观察到更多的等位基因。这个方法在两个独立的PCR反应中使用了两组引物。在第一个反应中，STR和临近的侧翼区域被扩增了。在第二轮反应中使用的引物被设计用来扩增一个较小的产物，方法是使用来源于第一轮PCR反应的一个等份试样作为DNA模板。巢式PCR减少了非特异的产物或者人工产物。我们已经证实，这个过程可被用于对一个单一细胞的内容进行上海亲子鉴定分析，720但是这个过程的不利之处是，必须将上海亲子鉴定PCR产物转移进一个独立的试管中，因而也就增加了污染的风险。