因等情况下，自动分型系统将不能完成对分型标准品的数字化命名p内标识别错误的常见原因是信号太低，分析范围设置错误和电泳数据不全。信号过低有时通过调整峰阈值可正确识别内标，若仍不能识别需要增加内标量重新电泳；上海亲子鉴定分析范围设置错误可通过调整分析范围纠正；电泳数据不全表现为内标片段没有被全部收集，数据未包含大片段的内标。如内标中包含80～500bp片段，电泳收集到400bp片段后被终止。这种情况下，通过修改分子量内标参数可以正确识别内标，但只能对小于400bp的片段进行分析。实践中，电泳时的环境温度对电泳速度有显著影响。25℃室温与10℃室温条件下的电泳速度有明显差异。电极缓冲液和毛细管使用次数过多，将使电泳分辨率下降。当上海亲子鉴定电泳系统不能有效分辨标准品中TH01基因座的9.3和10等位基因时，数据分析软件会把这两个等位基因峰识别为1个峰，软件对ladder进行等位基因命名时，找不到等位基因9.3或10而不能完成对ladder的数字化命名。另一种不能对ladder进行数字化命名的情况是电泳中发生.

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