建立在荧光基础上的检测分析技术，由于具有多色分析、快速和使用简便的特点，被上海亲子鉴定广泛应用于法医DNA分型中。荧光染料通常标记在每个基因座中一条引物的5’端，不同基因座引物标记不同的荧光标识物。扩增后的等位基因产物均携有荧光基团，经电泳分离后，用荧光扫描系统对凝胶检测。按照荧光的颜色及等位

     基因片段大小区域区别基因座，根据上海亲子鉴定片段的迁移率确定片段长度等位基因。荧光标记复合扩增系统不受各基因座基因长度重叠的影响，可以设计更多的基因座复合扩增，明湿提高了检测信息量。例如AmpFI STR Profiler PLus复合扩增系统同时扩增10个基因座：Amelogenin、D8S1179、D21SII和Dl8S51基因座用荧光染料JOE标记；D13S317、D7S820和D5S818用NED标记；D3S1358、vWA和FGA用5-FAM标记。近年来，激光诱导荧光标记STR自动分析技术的研究进展很快，应用的荧光染料种类逐渐增多，最新的技术采用了五色荧光，现已开发出多个16基因座荧光复合扩增的试剂盒。目前常用的常染色体荧光复合扩增系统,  常用的常染色体荧光复合扩增系统.

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